白谷雲水峡には、大きく分けて3つの主要コースがあります。

1. 弥生杉コース（約1時間）：樹齢3000年とも言われる「弥生杉」を見て戻る、最も短いコースです。
2. 奉行杉コース（約3時間）：『もののけ姫』の森のモデルと言われる「苔むす森」を通り、奉行杉などの屋久杉を巡るコースです。
3. 太鼓岩 往復コース（約4時間）：「苔むす森」を通り抜け、絶景の「太鼓岩」を目指して登る、最も人気のあるコースです。

白谷雲水峡は、標高600mから1,200mに位置する、424ヘクタールの広大な自然休養林です。

巨大な花崗岩、深い森、滝、そして550種以上とも言われる豊かな苔が特徴です。モミやツガ、そして樹齢1000年を超える「屋久杉」が混在する、原生的な森が広がっています。森を流れる沢のほとりには、苔に覆われた大きな岩が転がり、その中には「太鼓岩」と呼ばれる絶景スポットもあります。太鼓岩の上からは、屋久島の奥深い山々（奥岳）を見渡す壮大な景色が楽しめます。